Третий сезон, премьера которого состоялась 22 сентября 2008 года, состоит из 25 серий. Сезон включает в себя третий и четвертый тома, названный «Злодеи» и «Беглецы», соответственно. На протяжении третьего тома мы наблюдаем, как Сайлар обретает новые способности вместо утраченных ранее. Сюжет «Злодеев» начинается с покушения на Нейтана Петрелли, и его последствий в будущем. Помимо этого, несколько заключенных сбежали с 5 уровня и «Компания» делает все возможное, чтобы вернуть их обратно. Благодаря способности Адама Монро исцеляется Артур Петрелли. Он начинает собирать вокруг себя злодеев (Флинт Гордон мл., Нокс, Дафна Милбрук), которые заманивают в его сети Мохиндера Суреша, Нейтана Петрелли, Трейси Штраусс, Элль Бишоп и Сайлара. Они разрабатывают формулу, которая позволит каждому человеку на Земле обладать сверхспособностями. Но вскоре выясняется, что без «катализатора», находящегося в теле одного человека, все это не работает.
«Беглецы» начинаются с того, что Нейтан Петрелли сообщает президенту о существовании людей, обладающих невероятными способностями. Президент дает добро на поимку сверхлюдей. Большинство захвачено, но Сайлар, занятый поисками своего биологического отца, не позволяет агентам Нейтана схватить его. «Героям» помогает некто Бунтарь (англ. Rebel), как выясняется позже это Майк Сандерс.
Сезоны и эпизоды
Сериал «Штамм» закончится в следующем году
Сериал «Штамм» закончится в следующем году четвертым сезоном.